| 小麦高质量SNP对产量及根系表型的潜在影响分析与在线数据库的构建 |
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| 引用本文：胡尊铠，朱志伟，刘子辉，赵 鹏，王晓明，许盛宝.小麦高质量SNP对产量及根系表型的潜在影响分析与在线数据库的构建[J].西北农业学报,2023,(11):1718~1724 |
| DOI:10.7606/j.issn.1004-1389.2023.11.005 |
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| 基金项目:国家自然科学基金（31571756）。 |
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| 中文摘要:根据413份小麦苗期根系转录组测序数据，从中筛选得到45 898个高质量SNP，结合多年田间产量与实验室根系的群体表型，通过显著性差异分析，鉴定到123个SNP对千粒质量存在潜在影响，299个SNP对穗粒数存在潜在影响，1 660个SNP对有效分蘖数存在潜在影响，51个SNP对根表面积存在潜在影响，121个SNP对根体积存在潜在影响，97个SNP对根鲜质量存在潜在影响，并搭建小麦SNPs在线数据库 （TS-WheatDB），为小麦分子标记选择以及分子标记辅助育种提供参考。该数据库主要包含小麦SNP的位置信息、群体分布、变异类型以及对产量、根系表型影响情况，并提供查询和下载功能。 |
| 中文关键词:小麦 单核苷酸多态性 产量性状 根系表型 数据库 |
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| Potential Effect of High Quality SNPs in Wheat on Yield and Root Phenotype and Online Database Construction |
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| Abstract:45 898 high-quality SNPs from transcriptome sequencing of wheat root population was introduced,combined with population field yield traits and population root traits,123 SNPs had significant effect on kernel mass,299 SNPs on kernel number per spike,1 660 SNPs on productive tiller number,51 SNPs on root surface area,121 SNPs on root volume and 97 SNPs on root fresh mass. Based on this data,an online wheat SNPs database (TS-WheatDB) was established,which contains the SNP location information,SNP distribution in wheat population,SNP variation types,andtheeffects of these SNP on yield and root phenotypes. The database provides references for reference for molecular marker selection and marker-assisted breeding of wheat. |
| keywords:Wheat SNP Yield traits Root phenotypes Database |
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